在企业的股权结构中，股东的身份扮演着至关重要的角色。而股东的身份，主要分为自然人和企业法人两大类。这两者在税收、经营风险以及股权问题等方面，存在着显著的差异。

首先，从税收的角度来看，自然人股东和企业法人股东在分红所得上的处理方式截然不同。当公司有盈利并进行个人分红时，自然人股东需要按照股息红利所得，缴纳20%的个人所得税。这一规定意味着，自然人股东在享受公司盈利的同时，也必须承担相应的税负。而企业法人股东则不同，符合条件的居民企业之间的股息、红利等投资收益被视为免税收入，无需重复缴纳企业所得税。这一政策优惠为企业法人股东提供了更为灵活的资本运作空间。

其次，在经营风险方面，自然人股东和企业法人股东也面临着不同的挑战。自然人股东直接参与公司运营，一旦公司因经营风险导致异常或受到风险监控，自然人股东往往会第一时间受到牵连。例如，被列为失信被执行人、限制高消费等，甚至可能面临银行账户和其他财产的冻结。而企业法人股东则通过“企业法人”这一防火墙，与创始人和实际运营公司之间形成了一道屏障。由于股东是企业法人，有限公司以出资额为限承担有限责任，从而有效地隔离了创始人和实际运营公司的经营风险。

再者，股权问题也是自然人股东和企业法人股东之间的一大差异。随着公司的发展壮大，股东数量可能会逐渐增多。如果全由自然人持股，股权结构往往会变得非常分散，这不利于公司的稳定和发展。此外，自然人股东在转让股份时，需要得到其他股东的签字同意，如果对方不同意或失联，就可能无法完成转让。同时，如果股权存在溢价，溢价部分还需按照20%的比例缴纳个人所得税。而企业法人股东则可以通过成立家族公司或控股公司等方式，实现对实际运营公司的间接控制权。在进行股权转让时，也无需经过实际运营公司其他股东的签字同意，从而避免了繁琐的股权变更程序和对公司股权架构的影响。

综上所述，法人与自然人作为股东，在税收、经营风险以及股权问题等方面均存在显著的差异。这些差异不仅影响着股东的个人利益，也关系到公司的稳定和发展。因此，在选择股东身份时，应充分考虑公司的实际情况和未来发展需求，以做出最为明智的决策。