在企业的日常运营中，发票的开具是一个不可忽视的重要环节，尤其是对于小规模纳税人而言。小规模纳税人在开发票时，主要有两种形式：增值税普通发票（简称普票）和增值税专用发票（简称专票）。这两种发票在开具方式、税率以及税收优惠等方面都有所不同。本文将重点探讨小规模纳税人开具专票时，税率是1%还是3%的问题，并深入解析相关税务政策。

在过去，小规模纳税人如果需要开具专票，通常需要前往税务局进行代开。但如今，随着电子发票的普及，小规模纳税人已经能够自行开具电子专票，这无疑大大简化了开具流程，提高了工作效率。然而，在选择开具专票还是普票时，小规模纳税人需要谨慎考虑，因为两者在税收优惠方面存在显著差异。

对于小规模纳税人而言，增值税有一个重要的优惠政策：如果季度（不含税）销售额不超过30万元，那么这部分销售额是免收增值税的。但这一优惠政策仅适用于开具普票的情况。如果小规模纳税人选择开具专票，那么无论金额大小，专票上的增值税都是不能减免的。这意味着，在享受税收优惠方面，专票相比普票存在一定的劣势。

在税率方面，小规模纳税人的税率普遍是3%（有些特殊应税项目为5%）。然而，为了减轻企业税负，国家出台了相应的优惠政策，将小规模纳税人的税率减按1%征收。因此，在实际给客户开票时，小规模纳税人可以根据客户的要求以及自身的税务筹划需求，选择按1%或3%的税率来开具发票。

但需要注意的是，如果客户是一般纳税人，那么他收到小规模纳税人开具的发票后，只能按发票上注明的税率（1%或3%）进行抵扣。这意味着，一般纳税人抵扣了这部分税款后，这部分税款就需要由小规模纳税企业来缴纳。因此，在选择开具何种税率的发票时，小规模纳税人需要综合考虑客户的纳税身份以及自身的税务负担。

此外，小规模纳税人还需要注意的一点是，他们不能开具6%、9%、13%等税率的增值税发票。这主要是因为小规模纳税人的税务筹划相对简单，无法像一般纳税人那样进行复杂的进销项抵扣。因此，在与一般纳税人企业合作时，小规模纳税人可能会因为无法开具高税率的发票而增加对方的纳税成本。

综上所述，小规模纳税人在开具专票时，税率可以是1%也可以是3%，具体取决于客户的要求以及自身的税务筹划需求。但无论选择何种税率，小规模纳税人都需要充分了解相关的税务政策，确保自己的税务筹划符合法律法规的要求。同时，他们也需要合理利用税收优惠政策，减轻自身的税务负担。只有这样，才能在激烈的市场竞争中保持稳健的发展态势。